Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME3Q13232 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME3Q13232 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME3Q13232 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NME3Q13232 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME3Q13232 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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