Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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