Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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