Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 HOP1YIL072W 1818 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YCK3YER123W 1575 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YLR345WYLR345W 1530 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 MRPL9YGR220C 810 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YJL070CYJL070C 2667 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 TSR4YOL022C 1227 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 ARR2YPR200C 393 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 snR3snR3 194 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 AGC1YPR021C 2709 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 GRX1YCL035C 333 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 CSE4YKL049C 690 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 CRS5YOR031W 210 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YOR292CYOR292C 930 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 PRM2YIL037C 1971 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 QCR9YGR183C 201 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 SEN15YMR059W 387 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 MRPL27YBR282W 441 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 FRQ1YDR373W 573 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YOR029WYOR029W 336 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 MSN5YDR335W 3675 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 DSE4YNR067C 3354 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YJR003CYJR003C 1560 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 AAR2YBL074C 1068 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 CYC2YOR037W 1101 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YCK2YNL154C 1641 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 VPS38YLR360W 1320 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 OCT1YKL134C 2319 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 CNM67YNL225C 1746 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 PLP1YDR183W 693 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 MCM21YDR318W 1107 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 MCT1YOR221C 1083 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 CTM1YHR109W 1758 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 EST3YIL009C-A 546 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 MBA1YBR185C 837 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 RLI1YDR091C 1827 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-GR3Q12316 SMP3YOR149C 1551 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 SIP4YJL089W 2490 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 COS6YGR295C 1146 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 IST1YNL265C 897 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 NPL4YBR170C 1743 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 AEP2YMR282C 1743 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 REG1YDR028C 3045 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 MIC60YKR016W 1623 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 NDC80YIL144W 2076 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YDL073WYDL073W 2955 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 STP1YDR463W 1560 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 PRP38YGR075C 729 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YGR237CYGR237C 2358 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 ARP10YDR106W 855 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 RRF1YHR038W 693 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 VPH2YKL119C 648 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 FYV8YGR196C 2454 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 ATP25YMR098C 1839 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 ZRG17YNR039C 1818 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 CDC53YDL132W 2448 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 ARG2YJL071W 1725 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YCR050CYCR050C 309 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 RPS29AYLR388W 171 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YOL166CYOL166C 339 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 INP51YIL002C 2841 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 PET309YLR067C 2898 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 ISW2YOR304W 3363 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 UBC6YER100W 753 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 SHE2YKL130C 741 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 RMP1YLR145W 606 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 RDS2YPL133C 1341 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 SEC15YGL233W 2733 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 MRE11YMR224C 2079 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 CIK1YMR198W 1785 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 SPH1YLR313C 1593 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 SPO13YHR014W 876 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 PPE1YHR075C 1203 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 ESF2YNR054C 951 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YBR089WYBR089W 600 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YRR1YOR162C 2433 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 HIT1YJR055W 495 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 IRC21YMR073C 606 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 TOM1YDR457W 9807 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 SPO22YIL073C 2928 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 YCL019WYCL019W 5313 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 MET18YIL128W 3099 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 TCM62YBR044C 1719 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-GR3Q12316 BUR6YER159C 429 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-GR3Q12316 YGR242WYGR242W 309 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-GR3Q12316 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-GR3Q12316 DBP5YOR046C 1449 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-GR3Q12316 SOK1YDR006C 2706 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1B-GR3Q12316 SPS2YDR522C 1509 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1B-GR3Q12316 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.83□□□□□ -2.12
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