Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 MIS1YBR084W 2928 nt4.4□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 PEP7YDR323C 1548 nt4.4□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 MSC2YDR205W 2175 nt4.4□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 GPI17YDR434W 1605 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 CBF5YLR175W 1452 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ADI1YMR009W 540 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 SAP30YMR263W 606 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ATP3YBR039W 936 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 RPC40YPR110C 1008 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 HOYDL227C 1761 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 FLC1YPL221W 2382 nt4.39□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 BI4Q0120 1917 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YRM1YOR172W 2361 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 RTT105YER104W 627 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ECO1YFR027W 846 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 OTU2YHL013C 924 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 TCD1YHR003C 1290 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ECM15YBL001C 315 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 FBP1YLR377C 1047 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 SIL1YOL031C 1266 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 FRM2YCL026C-A 582 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YEH2YLR020C 1617 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 TGL3YMR313C 1929 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 MNT4YNR059W 1743 nt4.38□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 FMP25YLR077W 1752 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 GNT1YOR320C 1476 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ABP140YOR239W 1887 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 CYM1YDR430C 2970 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ARF2YDL137W 546 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 THI13YDL244W 1023 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 SNA2YDR525W-A 240 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ZEO1YOL109W 342 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 MGR2YPL098C 342 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 VAC8YEL013W 1737 nt4.37□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 NHX1YDR456W 1902 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 BRE5YNR051C 1548 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 RTC1YOL138C 4026 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 DBF20YPR111W 1695 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 STI1YOR027W 1770 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 SRD1YCR018C 666 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 GRX2YDR513W 432 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 SPI1YER150W 447 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 IRC18YJL037W 675 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YJR111CYJR111C 852 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YAL037WYAL037W 804 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 PAM18YLR008C 507 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YPL276WYPL276W 438 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 OSH6YKR003W 1347 nt4.36□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 STP2YHR006W 1626 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 RAD54YGL163C 2697 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 SRS2YJL092W 3525 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 PER1YCR044C 1074 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 UTP11YKL099C 753 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ERP4YOR016C 624 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YBR209WYBR209W 318 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 SYF1YDR416W 2580 nt4.35□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 OPI6YDL096C 327 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 MIC19YFR011C 513 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 RPL11BYGR085C 525 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YHL026CYHL026C 948 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YIR014WYIR014W 729 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 COA3YJL062W-A 258 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 ICY1YMR195W 384 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 VTI1YMR197C 654 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 YPR039WYPR039W 336 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 RPL11AYPR102C 525 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 PEX30YLR324W 1572 nt4.34□□□□□ -1.71
YLL054CQ12244 HUL5YGL141W 2733 nt4.34□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 MNN4YKL201C 3537 nt4.34□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 SWI1YPL016W 3945 nt4.34□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 UTP15YMR093W 1542 nt4.33□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 YDL009CYDL009C 324 nt4.33□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 SMX2YFL017W-A 234 nt4.33□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 YFL032WYFL032W 321 nt4.33□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 COX7YMR256C 183 nt4.33□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 IST1YNL265C 897 nt4.33□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 MRPL50YNR022C 420 nt4.33□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 PRP3YDR473C 1410 nt4.32□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 RTR2YDR066C 591 nt4.32□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 YDR102CYDR102C 333 nt4.32□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt4.32□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt4.32□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 NDC80YIL144W 2076 nt4.32□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 YCR023CYCR023C 1836 nt4.32□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 TAF6YGL112C 1551 nt4.31□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 RNA14YMR061W 2034 nt4.31□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 SCY1YGL083W 2415 nt4.31□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 IOC2YLR095C 2439 nt4.31□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 EXO70YJL085W 1872 nt4.31□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 RIA1YNL163C 3333 nt4.31□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 YDR340WYDR340W 303 nt4.31□□□□□ -1.72
YLL054CQ12244 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.6 ms