Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 COQ10YOL008W 624 nt2.35□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 YOL118CYOL118C 309 nt2.35□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 YPL150WYPL150W 2706 nt2.35□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 ERT1YBR239C 1590 nt2.35□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 VPS64YDR200C 1815 nt2.35□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 YJL181WYJL181W 1836 nt2.35□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 ARK1YNL020C 1917 nt2.34□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 VMA10YHR039C-A 345 nt2.34□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 ILV5YLR355C 1188 nt2.34□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 YSF3YNL138W-A 258 nt2.34□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 YNL276CYNL276C 396 nt2.34□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 YOR283WYOR283W 693 nt2.34□□□□□ -2.03
MSH5Q12175 YKL075CYKL075C 1353 nt2.34□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 POM152YMR129W 4014 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YDR090CYDR090C 933 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 RPL27BYDR471W 411 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 SPT15YER148W 723 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YKL066WYKL066W 444 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YMR181CYMR181C 465 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YMR046CYMR046C 1323 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YLR108CYLR108C 1458 nt2.33□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 DNF1YER166W 4716 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 STE11YLR362W 2154 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 MCD1YDL003W 1701 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 JJJ2YJL162C 1752 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 MRP10YDL045W-A 288 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 RSM24YDR175C 960 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 ALG14YBR070C 714 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 NEL1YHR035W 1893 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 NOP56YLR197W 1515 nt2.32□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 SIP3YNL257C 3690 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 SPB1YCL054W 2526 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 SAE2YGL175C 1038 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 ERG25YGR060W 930 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 NOP19YGR251W 591 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 PPE1YHR075C 1203 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 NGL1YOL042W 1092 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YPL142CYPL142C 318 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 BI3Q0115 1554 nt2.31□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 AMS1YGL156W 3252 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 NRG1YDR043C 696 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YHL044WYHL044W 708 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YIL141WYIL141W 390 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 CCE1YKL011C 1062 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YLL047WYLL047W 384 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 AIM32YML050W 936 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 FMP41YNL168C 780 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 RPL25YOL127W 429 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 CBP6YBR120C 489 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YHR078WYHR078W 1659 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 SWA2YDR320C 2007 nt2.3□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 TRM82YDR165W 1335 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 SLF1YDR515W 1344 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 BOS1YLR078C 735 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 ARC18YLR370C 537 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 ATG16YMR159C 453 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 FPR1YNL135C 345 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 MER1YNL210W 813 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YNL234WYNL234W 1281 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 ISU1YPL135W 498 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 APC2YLR127C 2562 nt2.29□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 EDS1YBR033W 2760 nt2.28□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 RTG3YBL103C 1461 nt2.28□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 SEC4YFL005W 648 nt2.28□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YGR111WYGR111W 1203 nt2.28□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YOR277CYOR277C 309 nt2.28□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.28□□□□□ -2.04
MSH5Q12175 DBP10YDL031W 2988 nt2.28□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 UBC9YDL064W 474 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YRB1YDR002W 606 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 DPP1YDR284C 870 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 ERG28YER044C 447 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 RPL19BYBL027W 570 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YOR097CYOR097C 528 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 CCL1YPR025C 1182 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 STH1YIL126W 4080 nt2.27□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YFH1YDL120W 525 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YFR054CYFR054C 579 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YJL114WYJL114W 681 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 DYN3YMR299C 939 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 PNO1YOR145C 825 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 MRPL40YPL173W 894 nt2.26□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YGL039WYGL039W 1047 nt2.25□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SED5YLR026C 1023 nt2.25□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 PAU23YLR037C 375 nt2.25□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.25□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 CRS5YOR031W 210 nt2.25□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SSD1YDR293C 3753 nt2.25□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 BNI1YNL271C 5862 nt2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.7 ms