Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.4□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 YLR428CYLR428C 345 nt5.4□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 INO4YOL108C 456 nt5.4□□□□□ -1.54
TFB4Q12004 HIR1YBL008W 2523 nt5.4□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 RIM13YMR154C 2184 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 PRP43YGL120C 2304 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YFR035CYFR035C 345 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YFR054CYFR054C 579 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YAL065CYAL065C 387 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YAR068WYAR068W 486 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YPL062WYPL062W 405 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YJL016WYJL016W 1686 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YOL019WYOL019W 1656 nt5.39□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 HCS1YKL017C 2052 nt5.38□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YFH1YDL120W 525 nt5.38□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 SIP2YGL208W 1248 nt5.38□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YJL135WYJL135W 318 nt5.38□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 HOP1YIL072W 1818 nt5.38□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 ALD3YMR169C 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 SCW11YGL028C 1629 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 MNT2YGL257C 1677 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 NUP116YMR047C 3342 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 MSC7YHR039C 1935 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 TIF35YDR429C 825 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YER076W-AYER076W-A 348 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YFR056CYFR056C 369 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 NSG1YHR133C 876 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YIL141WYIL141W 390 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YAR070CYAR070C 300 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 ILV5YLR355C 1188 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YBL073WYBL073W 312 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 CDC9YDL164C 2268 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 BNA4YBL098W 1383 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 GAL4YPL248C 2646 nt5.37□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YLL032CYLL032C 2478 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 BUL1YMR275C 2931 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 SNA4YDL123W 423 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 IRC4YDR540C 540 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YGL042CYGL042C 306 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 PET191YJR034W 327 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 VPS73YGL104C 1461 nt5.36□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 SUM1YDR310C 3189 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 HSF1YGL073W 2502 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YNL193WYNL193W 1677 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 RSC6YCR052W 1452 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YJL150WYJL150W 303 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 SIL1YOL031C 1266 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YPL238CYPL238C 390 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 DAL81YIR023W 2913 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 PXA1YPL147W 2613 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 MBP1YDL056W 2502 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YDL199CYDL199C 2064 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 GDB1YPR184W 4611 nt5.35□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 HPC2YBR215W 1878 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 THI7YLR237W 1797 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 CPS1YJL172W 1731 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 PHO87YCR037C 2772 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 HXT14YNL318C 1623 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YGR164WYGR164W 336 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 RPL40AYIL148W 387 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 YAE1YJR067C 426 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 GTT2YLL060C 702 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 TMA10YLR327C 261 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 RPS7BYNL096C 573 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 SSO1YPL232W 873 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 GRS1YBR121C 2004 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 TRK2YKR050W 2670 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 SPC72YAL047C 1869 nt5.34□□□□□ -1.55
TFB4Q12004 EAP1YKL204W 1899 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 ATP17YDR377W 306 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 ALG13YGL047W 609 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 SGN1YIR001C 753 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 YLR230WYLR230W 306 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 RPL6BYLR448W 531 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 PRE8YML092C 753 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 OPY2YPR075C 1083 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 MMP1YLL061W 1752 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 HUL5YGL141W 2733 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 IZH3YLR023C 1632 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 PKC1YBL105C 3456 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 ADE4YMR300C 1533 nt5.33□□□□□ -1.56
TFB4Q12004 YGL036WYGL036W 2730 nt5.32□□□□□ -1.56
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