Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms