Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDR1Q08345 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms