Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FMODQ06828 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FMODQ06828 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms