Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 SEC9YGR009C 1956 nt4.81□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 PRM1YNL279W 1986 nt4.81□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 PXA1YPL147W 2613 nt4.81□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 MKT1YNL085W 2493 nt4.81□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 OAF1YAL051W 3144 nt4.81□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 APC5YOR249C 2058 nt4.81□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 EPO1YMR124W 2832 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YMR102CYMR102C 2505 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 ATP8Q0080 147 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 EMI1YDR512C 564 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 EFB1YAL003W 621 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 LSO1YJR005C-A 282 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 FCF2YLR051C 654 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 SIN4YNL236W 2925 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 MED1YPR070W 1701 nt4.8□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 RIM21YNL294C 1602 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 PRP43YGL120C 2304 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 TPO2YGR138C 1845 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 NIC96YFR002W 2520 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 RRN11YML043C 1524 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 MVB12YGR206W 306 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YHR212CYHR212C 336 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 CNB1YKL190W 528 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YAR060CYAR060C 336 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YLR428CYLR428C 345 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 SIL1YOL031C 1266 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 CIN5YOR028C 888 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 SRL1YOR247W 633 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YPR077CYPR077C 372 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 PAN1YIR006C 4443 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 ULP1YPL020C 1866 nt4.79□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 ASI1YMR119W 1875 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 HSP30YCR021C 999 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 TRX3YCR083W 384 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 snR80snR80 171 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 CYC7YEL039C 342 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 VEL1YGL258W 621 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 MIM2YLR099W-A 264 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 YBL108WYBL108W 306 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 TIR2YOR010C 756 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 TOM5YPR133W-A 153 nt4.78□□□□□ -1.64
HDA3Q06623 PCK1YKR097W 1650 nt4.77□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 IMD4YML056C 1575 nt4.77□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 AXL2YIL140W 2472 nt4.77□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 TUB3YML124C 1338 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 TPS3YMR261C 3165 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YDR338CYDR338C 2088 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YDL094CYDL094C 510 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 MSC2YDR205W 2175 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YER079C-AYER079C-A 339 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 RPS8BYER102W 603 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 SPR6YER115C 576 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 IST1YNL265C 897 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YOR385WYOR385W 873 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 PIS1YPR113W 663 nt4.76□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 ASK10YGR097W 3441 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 RPN6YDL097C 1305 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 MUB1YMR100W 1863 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 SFI1YLL003W 2841 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 CEP3YMR168C 1827 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 LHP1YDL051W 828 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 SNA4YDL123W 423 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YAL004WYAL004W 648 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 SIP18YMR175W 240 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 HUB1YNR032C-A 222 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YPR136CYPR136C 513 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 HIR2YOR038C 2628 nt4.75□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 NNK1YKL171W 2787 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 AHA1YDR214W 1053 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 JAC1YGL018C 555 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YJL202CYJL202C 348 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YAR068WYAR068W 486 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 CWC24YLR323C 780 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 SMA2YML066C 1110 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 GDT1YBR187W 843 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 TUB2YFL037W 1374 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 IRC3YDR332W 2070 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 KRE6YPR159W 2163 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 CRT10YOL063C 2874 nt4.74□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 MNR2YKL064W 2910 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 PRP28YDR243C 1767 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 SRC1YML034W 2505 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 FAA3YIL009W 2085 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 LYS2YBR115C 4179 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 ATP5YDR298C 639 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 AST2YER101C 1293 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 SLX8YER116C 825 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YGL042CYGL042C 306 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YGR242WYGR242W 309 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 snR13snR13 124 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 MSC7YHR039C 1935 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 FZO1YBR179C 2568 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 KAR2YJL034W 2049 nt4.73□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 ALR2YFL050C 2577 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 FKH2YNL068C 2589 nt4.72□□□□□ -1.65
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