Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSME1Q06323 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME1Q06323 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms