Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC9Q06265 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms