Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN1Q05586 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms