Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNC4Q03721 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNC4Q03721 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms