Protein–RNA interactions for Protein: Q03338

PRP3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP3Q03338 SFT1YKL006C-A 294 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YKL070WYKL070W 510 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 RPL8BYLL045C 771 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 RPL6BYLR448W 531 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 PRM6YML047C 1059 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 FAR3YMR052W 615 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 CIN2YPL241C 807 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 RFC5YBR087W 1065 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YNR063WYNR063W 1824 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 ILS1YBL076C 3219 nt2.88□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YBP2YGL060W 1926 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 ANR2YKL047W 1551 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 HFD1YMR110C 1599 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 GCD10YNL062C 1437 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YTA7YGR270W 4140 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 NRG1YDR043C 696 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 FMP32YFL046W 624 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 GTR2YGR163W 1026 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 RSM27YGR215W 333 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 OTU2YHL013C 924 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 SMD2YLR275W 333 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 ILV5YLR355C 1188 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 COQ10YOL008W 624 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 IPP1YBR011C 864 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 SLM4YBR077C 489 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 MED8YBR193C 672 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 KAR4YCL055W 1008 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 FAR11YNL127W 2862 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YER138CYER138C 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YER160CYER160C 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YJR027WYJR027W 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YML039WYML039W 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YML045WYML045W 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YMR050CYMR050C 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 SHQ1YIL104C 1524 nt2.87□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 MLH1YMR167W 2310 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 CSF1YLR087C 8877 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 VMA10YHR039C-A 345 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 COX23YHR116W 456 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 SRL3YKR091W 741 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 CWC24YLR323C 780 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 RPS29AYLR388W 171 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 ADI1YMR009W 540 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 PEX27YOR193W 1131 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 ATP3YBR039W 936 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 ESA1YOR244W 1338 nt2.86□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 MDM36YPR083W 1740 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 NOP56YLR197W 1515 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 HLR1YDR528W 1272 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YJL032WYJL032W 315 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 PDR17YNL264C 1053 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 snR24snR24 89 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 CYR1YJL005W 6081 nt2.85□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 MUB1YMR100W 1863 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 SIR3YLR442C 2937 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 RPL14BYHL001W 417 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 YIL141WYIL141W 390 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 GRX5YPL059W 453 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 NIP7YPL211W 546 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 RPC40YPR110C 1008 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 KRE33YNL132W 3171 nt2.84□□□□□ -1.95
PRP3Q03338 NGG1YDR176W 2109 nt2.84□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 RIM13YMR154C 2184 nt2.84□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 Q0255Q0255 1419 nt2.84□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 STE6YKL209C 3873 nt2.84□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 TFB1YDR311W 1929 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 UTP15YMR093W 1542 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 ATP16YDL004W 483 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 YDR193WYDR193W 399 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 RMD6YEL072W 696 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 YHR212CYHR212C 336 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 YKL069WYKL069W 543 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 YKL115CYKL115C 393 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 ATG10YLL042C 504 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 YAR060CYAR060C 336 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 YMR187CYMR187C 1296 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 SYO1YDL063C 1863 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 NEL1YHR035W 1893 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 AGE1YDR524C 1449 nt2.83□□□□□ -1.96
PRP3Q03338 CST9YLR394W 1449 nt2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms