Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2BQ02880 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2BQ02880 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms