Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF8Q02556 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms