Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG1Q02413 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms