Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BDH1Q02338 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms