Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MS4A2Q01362 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms