Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN7AQ01118 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN7AQ01118 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms