Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MYBPC1Q00872 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MYBPC1Q00872 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms