Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX1P83916 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX1P83916 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX1P83916 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX1P83916 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms