Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA4P83105 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms