Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFI35P80217 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFI35P80217 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFI35P80217 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFI35P80217 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFI35P80217 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFI35P80217 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFI35P80217 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFI35P80217 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFI35P80217 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms