Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTG1P63261 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms