Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P63121 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms