Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL11P62913 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL11P62913 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL11P62913 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL11P62913 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL11P62913 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL11P62913 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms