Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHOBP62745 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOBP62745 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms