Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms