Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK1P57059 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK1P57059 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK1P57059 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SIK1P57059 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK1P57059 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK1P57059 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK1P57059 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK1P57059 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK1P57059 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK1P57059 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK1P57059 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK1P57059 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK1P57059 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK1P57059 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK1P57059 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms