Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX10P56693 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX10P56693 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX10P56693 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX10P56693 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SOX10P56693 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX10P56693 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX10P56693 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX10P56693 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms