Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATN1P54259 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATN1P54259 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATN1P54259 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATN1P54259 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATN1P54259 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms