Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMTNP53814 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMTNP53814 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMTNP53814 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMTNP53814 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms