Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP2S1P53680 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms