Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYBA4P53673 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRYBA4P53673 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRYBA4P53673 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRYBA4P53673 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRYBA4P53673 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRYBA4P53673 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms