Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPAP53621 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPAP53621 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPAP53621 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPAP53621 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPAP53621 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPAP53621 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPAP53621 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms