Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ARFIP2P53365 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFIP2P53365 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms