Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF143P52747 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF143P52747 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF143P52747 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF143P52747 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF143P52747 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF143P52747 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF143P52747 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF143P52747 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms