Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA2P51531 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA2P51531 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA2P51531 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms