Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNN1GP51170 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms