Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATMP50440 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GATMP50440 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GATMP50440 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GATMP50440 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATMP50440 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATMP50440 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATMP50440 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATMP50440 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATMP50440 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATMP50440 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms