Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP4P49662 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP4P49662 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP4P49662 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP4P49662 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP4P49662 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP4P49662 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP4P49662 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP4P49662 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP4P49662 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP4P49662 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP4P49662 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms