Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRPC1P48995 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRPC1P48995 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms