Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI2P48788 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI2P48788 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms