Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NESP48681 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NESP48681 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NESP48681 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NESP48681 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NESP48681 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NESP48681 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NESP48681 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NESP48681 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NESP48681 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NESP48681 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NESP48681 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
NESP48681 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NESP48681 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NESP48681 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NESP48681 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NESP48681 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NESP48681 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NESP48681 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NESP48681 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NESP48681 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NESP48681 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NESP48681 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NESP48681 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NESP48681 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NESP48681 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NESP48681 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NESP48681 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NESP48681 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NESP48681 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
NESP48681 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NESP48681 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NESP48681 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NESP48681 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NESP48681 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
NESP48681 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NESP48681 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NESP48681 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NESP48681 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NESP48681 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NESP48681 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NESP48681 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NESP48681 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NESP48681 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
NESP48681 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
NESP48681 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NESP48681 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NESP48681 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms