Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF4P48230 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms