Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT3P45378 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms