Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCAMP43121 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCAMP43121 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCAMP43121 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCAMP43121 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCAMP43121 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCAMP43121 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCAMP43121 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCAMP43121 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms